Κόβετε τις πιπεριές στη μέση και τις ξεσποριάζετε, χωρίς να βγάλετε το κοτσάνι. Σε ένα ταψί στρώνετε τα κολοκυθάκια και τα τοματίνια, πασπαλίζετε με λίγο αλάτι, τοποθετείτε από πάνω τις πιπεριές και ψήνετε για 15 λεπτά, στους 180°C.
Σοτάρετε με το ελαιόλαδο το κρεμμύδι, προσθέτετε το Πλιγούρι Fytro και το κουκουνάρι και συνεχίζετε το σοτάρισμα. Προσθέτετε 2 1/2 φλιτζάνια του τσαγιού νερό και μαγειρεύετε, μέχρι να εξατμισθούν όλα τα υγρά. Κατεβάζετε από τη φωτιά, προσθέτετε τα μυρωδικά και τις ελιές, ανακατεύετε και αλατοπιπερώνετε.
Γεμίζετε τις πιπεριές με το μίγμα με το πλιγούρι, σκεπάζετε με μια λαδόκολλα και αλουμινόχαρτο και ψήνετε στους 170°C, για 35 λεπτά. Αφαιρείτε τη λαδόκολλα και το αλουμινόχαρτο και ψήνετε άλλα 5 λεπτά, στην ίδια θερμοκρασία.
Σερβίρετε, εάν θέλετε, μαζί με γιαούρτι.